La formación de la RED AFRIMAR, tiene sus inicios en 2006, cuando cuatro países (Cabo Verde, Senegal, Guinea Bisseau y Guinea) que forman parte de la Eco-región Marina del África Occidental (WAMER), y España, inician, a través de un proyecto de la AECID, la formación de una red para la gestión sostenible de los recursos marinos: AFRIMAR.

Durante el proceso de creación de la red se suman al proyecto 3 nuevos países: Gambia,Mauritania y Sierra Leona

El 2/11/2007 queda oficialmente constituida la red.

En 2007 se adhieren Marruecos y São Tomé & Principe y en 2009 Portugal.